Die Ausgliederung von Kopf und Fuss in einzelne Dateien ist üblich und eine gängige Methode, wenn du HTML und PHP vermischst.

Wenn du gedenkst auch in Zukunft (dynamische) Webseiten zu erstellen rat ich dir dazu die Bedienung eines MVC Frameworks zu erlernen.

Für PHP gibts da Symfony, ruby = ruby on rails, perl = catalyst, ...

Sicher, der Einarbeitsaufwand ist hoch aber dann gehts nur so dahin und deine Applikationen sind auch einfacher zu warten und evt abzusichern

PHP selber ist ja eigentlich nichts anderes als ein "TemplateSystem". so gesehen ist die trennung von logik und präsentation schon gegeben, ohne smarty oder dergleichen. du kannst ja zb einfach jedes element (header, footer, navigation, etc..) in deiner website in eine variable schreiben und diese am ende einfach in einer bestimmten reihenfolge ausgeben.

ein großer nachteil an den gängigen template-engines ist ja, dass jede ihre eigene syntax hat welche man lernen muss. deswegen rate ich dazu einen xslt-processor zu verwenden, den man mit xml (daten) und xsl (template) füttert. die syntax von xsl ist standardisiert (standardisierte W3C Verarbeitungsanweisung) und es gibt ettliche tools dafür. so ist dann auch die ausgabe in mehreren formaten möglich (xhtml, pdf, svg, docbook, ..). wobei zum generieren von pdf ein eigener print formater benötigt wird, zb FOP (java, daher PHPJavaBridge).

du könntest zb ganz einfach die antwort auf ein sqlQuery per pear::XML_Query2XML als xml ausgeben, wobei du dann im xsl-template angibst wo welches element wie positioniert werden soll. das xml und das xsl übergibst du dem XSLTProcessor (libxslt - ab php5), welcher dann zb das xhtml generiert.

wie auch immer, hier noch ein paar interessante links zum thema: #php@quakenet-tutorial, pear::HTML_Template_Flexy, smarty, jTemplate, XSLT als template-engine, W3C-XSLvsCSS, W3C-XSLandCSS