Linuxserver --> mit studentenlizenz problematisch.
Matlab Compiler --> IMHO nicht in TU-Version enthalten.

Evtl. hat dein Betreuer Zugang zu einer Enterprise-Version mit Compiler.

Evtl. laeft dein Script auch unter Scilab. (koennte man am Server installieren)
http://de.wikipedia.org/wiki/Scilab

Der Matlab Compiler 4.9 ist nur in der aktuellen Campus Version (Arbeitsplatzsoftware für Mitarbeiter d. TU Wien) erhältlich.

Die Studentenversion hat ~10-13 Toolboxen inkludiert, die Campus Version über 40.
http://selma.zid.tuwien.ac.at/infos/matlab7.…-toolboxen.html

Für deinen Betreuer sollte es allerdings möglich sein, dir eine solche zu organisieren.

Nebenbei erwähnt: während bei der Studentenversion alle 3 OS-Versionen auf einer CD sind,
sind bei der Campus Version alle 3 OS-Versionen getrennt bestellbar. Kostenpunkt wäre fürs Institut ~35 Euro pro Quartal pro freigeschaltener Matlab-Lizenz am Software-Server.
(Lizenzkey gilt aber sowieso immer für ein Jahr..) Vermutlich haben sie zumindest für Linux ohnehin welche bestellt/verfügbar.